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質(zhì)譜上準(zhǔn)確鑒定未知化合物究竟需要達(dá)到多少的質(zhì)量精度?50、5、還是1ppm?

關(guān)鍵詞:質(zhì)譜 質(zhì)量精度
時(shí)間:2024-09-11 13:44:10

  質(zhì)譜的質(zhì)量精度是衡量質(zhì)譜定性能力的一個(gè)重要指標(biāo),當(dāng)前常見(jiàn)的高分辨質(zhì)譜系統(tǒng)(TOF、Orbitrap)的質(zhì)量精度為通常在1-5ppm之間,但我們很難通過(guò)測(cè)定的精確質(zhì)量數(shù)得到未知物的唯一分子式,特別是對(duì)于m/z > 400的化合物。

如圖1所示,即使質(zhì)量精度達(dá)到FT-MS的0.1 ppm以內(nèi),隨著分子量的增大,分子式的可能性越來(lái)越多。因此,僅靠質(zhì)譜的高質(zhì)量精度,往往并不能確定一個(gè)唯一的分子式,尤其是當(dāng)要考慮到更多的元素種類時(shí)。

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圖1:不同質(zhì)量精度下的元素組成個(gè)數(shù)

(數(shù)據(jù)來(lái)源:Tobias Kind and Oliver Fiehn, BMC Bioinformatics 2006, 7:234)

質(zhì)譜上測(cè)定一個(gè)化合物時(shí)得到的信息不只是單同位素峰的精確質(zhì)量,還包括了它的重同位素峰及其相對(duì)分布。Tobias Kind和Oliver Fiehn在2006年的文章中已經(jīng)證明了同位素比例結(jié)合精確質(zhì)量數(shù)在減少可能的元素組成方面比單純依靠更高的分辨率和質(zhì)量精度更占優(yōu)勢(shì)。在下文中,我們將在高分辨率(TOF或Orbitrap)和傳統(tǒng)的單或三重四極質(zhì)譜系統(tǒng)上進(jìn)行實(shí)驗(yàn),介紹和質(zhì)量精度和同位素譜圖準(zhǔn)確度(Spectral Accuracy)相結(jié)合對(duì)未知物分子式鑒定的作用。

  四極桿質(zhì)譜上的未知物的分子式測(cè)定

  在MassWorks軟件中借助TrueCal?校正技術(shù),可以將四極桿質(zhì)譜的質(zhì)量精度提高100倍以上,將質(zhì)量精度從0.x提升至0.00x的質(zhì)量精度。結(jié)合在校正過(guò)程獲得的無(wú)與倫比的譜圖準(zhǔn)確度(Spectral Accuracy),通過(guò)CLIPS檢索分析,就可以在四極桿GC/MS或LC/MS上來(lái)獲得鑒定未知化合物的分子式的能力。我們對(duì)LC/MS測(cè)定的C25H23N2OS+進(jìn)行了分析,MassWorks軟件測(cè)定的精確質(zhì)量數(shù)m/z = 399.1448,圖2顯示CLIPS檢索分析的條件,設(shè)定可能元素組成為C、H、N、O、S,檢索的質(zhì)量誤差為 ±20mDa。

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圖2:CLIPS檢索條件

  圖3顯示了CLIPS檢索分析的結(jié)果,列表中一共有126個(gè)可能的候選分子式。當(dāng)我們用同位素的譜圖準(zhǔn)確度(Spectral Accuracy)進(jìn)行排序時(shí),譜圖準(zhǔn)確度≥98.5%的候選分子式只有5個(gè),正確的分子式C25H23N2OS被準(zhǔn)確地顯示在了列表中的第1位。

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圖3:C25H23N2OS的CLIPS分子式檢索結(jié)果(按譜圖準(zhǔn)確度從高至低排序)

正確分子式C25H23N2OS的譜圖準(zhǔn)確度為99.1%,圖4(上)顯示了其理論譜圖和校正譜圖的對(duì)比,兩者完美重合。圖4(下)顯示了排名第1、5、6位分子式的理論譜圖的對(duì)比,可以看到,由于C原子個(gè)數(shù)的不同,在重同位素A+1處,存在明顯的豐度差異,譜圖準(zhǔn)確度越高,分子式正確的可能越高。因此譜圖準(zhǔn)確度是幫我們識(shí)別正確分子式的一個(gè)重要指標(biāo)。

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  圖4:(上)校正譜圖與排序第一的分子式的理論同位素分布比較;(下)排序1、5、6位分子式的理論同位素分布比較

如果只考慮質(zhì)量精度,我們需要達(dá)到多少的精度才能幫助我們?nèi)フ业侥繕?biāo)分子式呢?我們假設(shè)了理論的精確質(zhì)量為實(shí)測(cè)值,重新進(jìn)行了CLIPS分子式檢索,并將分子式的排序設(shè)定為按質(zhì)量誤差排序,結(jié)果見(jiàn)圖5。在得到的119個(gè)待選結(jié)果中,至少需要質(zhì)量精度優(yōu)于1.5ppm才能在前5個(gè)候選分子式中找到正確的分子式。

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  圖5:C25H23N2OS的分子式檢索結(jié)果(按質(zhì)量誤差從小到大排序)

  高分辨質(zhì)譜TOF的未知物的分子式測(cè)定

  在MassWorks軟件中通過(guò)sCLIPS檢索分析,可以對(duì)TOF數(shù)據(jù)進(jìn)行全面的峰形校正以獲得高的譜圖準(zhǔn)確度。圖6顯示了C43H74NO15的質(zhì)譜圖校正前后的對(duì)比。

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圖6:化合物C43H74NO15的TOF數(shù)據(jù)校正前后的比較

圖7為sCLIPS檢索分析時(shí)設(shè)定的檢索參數(shù),設(shè)定可能元素組成為C、H、N、O、S,檢索的質(zhì)量誤差為 ±5ppm。

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  圖7:sCLIPS檢索條件

  圖8顯示了sCLIPS檢索分析的結(jié)果,列表中一共有63個(gè)可能的候選分子式。當(dāng)我們用同位素的譜圖準(zhǔn)確度(Spectral Accuracy)進(jìn)行排序時(shí),分別只有3個(gè)或2個(gè)候選分子式的譜圖準(zhǔn)確度≥98%或98.5%,正確的分子式C43H74NO15被準(zhǔn)確地顯示在了列表中的第1位。

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圖8:C43H74NO15的sCLIPS分子式檢索結(jié)果(按譜圖準(zhǔn)確度從高至低排序)

  正確分子式C43H74NO15的譜圖準(zhǔn)確度為98.97%,圖9(上)顯示了其理論譜圖和校正譜圖的對(duì)比,兩者完美重合。圖9(下)顯示了排名第1、3、4位分子式的理論譜圖的對(duì)比,可以看出排序第4的分子式的同位素分布的誤差明顯大于前兩個(gè)分子式,因此在實(shí)際的驗(yàn)證分析中,我們只需要考察前三個(gè)分子式。

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圖9:(上)校正譜圖與排序第一的分子式的理論同位素分布比較;(下)排序1、3、4位分子式的理論同位素分布比較

  既然通過(guò)譜圖準(zhǔn)確度能幫我們準(zhǔn)確地將分子式鎖定在前3位,那如果只考慮質(zhì)量精度,我們的TOF需要達(dá)到多少的精度才能幫助我們?nèi)フ业侥繕?biāo)分子式呢?我們假設(shè)了理論的精確質(zhì)量為實(shí)測(cè)值,重新進(jìn)行了sCLIPS分子式檢索,并將分子式的排序設(shè)定為按質(zhì)量誤差排序,結(jié)果見(jiàn)圖10。在得到的候選結(jié)果中,需要具有高于0.2ppm或0.02ppm的非常高的質(zhì)量精度,才能分別在前3個(gè)或前2個(gè)候選元素中找到正確的元素組成。

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圖10:C43H74NO15的分子式檢索結(jié)果(按質(zhì)量誤差從小到大排序)

   結(jié)論 

  1)四極桿質(zhì)譜上:[20mDa質(zhì)量精度+98.5%譜圖準(zhǔn)確度精度]=1.5ppm

20mDa (50ppm @ 400Da)的質(zhì)量誤差與98.5%的譜圖準(zhǔn)確度相結(jié)合,通過(guò)TrueCal可以在大多數(shù)單、三重四極桿質(zhì)譜系統(tǒng)上實(shí)現(xiàn),等同于1.5ppm的質(zhì)量精度的分子式鑒定效果,且正確的分子式排在前5位,這相當(dāng)于TOF的未知物鑒定水平。

2)高分辨質(zhì)譜上:[5ppm質(zhì)量精度+98.0%譜圖準(zhǔn)確度]=0.2ppm

5ppm的質(zhì)量精度(@845Da)結(jié)合98.0%的譜圖準(zhǔn)確度,可以在高分辨質(zhì)譜系統(tǒng)上實(shí)現(xiàn)等同于0.2ppm質(zhì)量精度的分子式鑒定效果,且正確的元素組成排在前3位。3)在未知物的鑒定分析中,無(wú)需過(guò)分地追求更優(yōu)的質(zhì)量精度,更好的質(zhì)量精度意味著更高的硬件投入成本;而是應(yīng)該考慮質(zhì)量精度+譜圖準(zhǔn)確度的組合,在現(xiàn)有的質(zhì)譜系統(tǒng)上,通過(guò)譜圖準(zhǔn)確度來(lái)提升質(zhì)譜系統(tǒng)的未知物鑒定潛力。如四極桿質(zhì)譜+MassWorks軟件來(lái)達(dá)到TOF的未知物定性效果。

關(guān)于MassWorks

  軟件MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開(kāi)發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們?cè)诘头直媛实乃臉O桿GC/MS、LC/MS直接測(cè)定化合物的精確質(zhì)量,并通過(guò)獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。

  關(guān)于綠綿科技

綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國(guó)區(qū)的總代理商,負(fù)責(zé)Cerno公司旗下的MassWorks、GC/ID 等產(chǎn)品市場(chǎng)推廣、銷售、售前/售后技術(shù)支持、應(yīng)用支持。若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應(yīng)用,歡迎致電綠綿科技!


關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡(jiǎn)稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價(jià)值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測(cè)的效率和水平。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8 E-mail:[email protected]。