未知物分析:在單四極桿GC/MS上鑒定譜庫(kù)中未收錄化合物的策略
GC/MS中的完全未知物的定性分析
GC/MS分析完全未知的化合物,是指未收錄于 GC/MS 數(shù)據(jù)庫(kù)中的化合物。
化合物的鑒定很重要,但傳統(tǒng)的鑒定方法十分繁瑣。
使用高分辨率質(zhì)譜儀以獲取可能的分子式
可能需要進(jìn)行 “軟” 電離。
運(yùn)行串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)以幫助推斷結(jié)構(gòu)。
分離出一定量的化合物,以便通過(guò)其他技術(shù)(核磁共振、紅外光譜等)進(jìn)行分析。
購(gòu)買(mǎi) / 合成可能的化合物,運(yùn)行 GC/MS,并匹配保留時(shí)間和質(zhì)譜圖。
是否存在更快速、更經(jīng)濟(jì)的方法?
單四極桿 GC/MS 分析中,有哪些方法可用于進(jìn)行譜庫(kù)未收錄化合物的鑒定?
通過(guò)利用校準(zhǔn)后的質(zhì)譜數(shù)據(jù)獲得精確質(zhì)量 / 譜圖準(zhǔn)確度,從而得到分子式。
進(jìn)行NIST的 “Hybrid Search”,該檢索方法可查找數(shù)據(jù)庫(kù)中不存在但相關(guān)的化合物。
利用AI預(yù)測(cè)的保留指數(shù)(NIST AIRI),通過(guò)保留指數(shù)進(jìn)行確認(rèn)或篩選。
四極桿上GC/MS的分子式鑒定——由MassWorks軟件輔助
校準(zhǔn)后的Profile輪廓模式數(shù)據(jù)可提供良好的質(zhì)量準(zhǔn)確度(約 ±10 mDa),與譜圖準(zhǔn)確度相結(jié)合,可實(shí)現(xiàn)幾 ppm 的有效質(zhì)量準(zhǔn)確度。
操作簡(jiǎn)單。
以Profile輪廓模式運(yùn)行數(shù)據(jù)。
在運(yùn)行結(jié)束時(shí)短暫開(kāi)啟質(zhì)譜調(diào)諧液(全氟三丁胺,PFTBA)。
軟件會(huì)自動(dòng)校準(zhǔn)數(shù)據(jù)。
數(shù)據(jù)分析由MassWorks軟件來(lái)完成,最終得到精確質(zhì)量和分子式。
四極桿GC/MS在Profile輪廓圖模式下測(cè)定化合物的精確質(zhì)量,并通過(guò)理論同位素峰(綠色)和樣品校正同位素(紅色)的譜圖準(zhǔn)確度識(shí)別出正確的分子式
混合檢索:Hybrid Search
Hybrid Search可匹配碎片離子和中性丟失。
通過(guò)納入 “近鄰” 化合物來(lái)擴(kuò)展數(shù)據(jù)庫(kù)的范圍。
需要數(shù)據(jù)庫(kù)中存在相似的化合物。
必須知道名義分子量,最好還知道分子式。
質(zhì)量差異必須局限于分子的單個(gè)區(qū)域,且分子的碎裂行為為沒(méi)有顯著變化。
Delta Mass 代表數(shù)據(jù)庫(kù)中化合物與未知分子之間的差異(修飾)。
混合檢索Hybrid search結(jié)果示例
保留指數(shù)校準(zhǔn)
保留指數(shù)可以用于定性分析未知化合物,它比保留時(shí)間更可靠,因?yàn)樗慌c固定相類(lèi)別和柱溫有關(guān),受其他因素影響較小?。
保留指數(shù)通常可由正構(gòu)烷系列混合標(biāo)樣進(jìn)樣后校正得到,還有一種新的方法——可以通過(guò)保留指數(shù)自動(dòng)校正技術(shù)(如Auto RI,GC/ID)來(lái)計(jì)算保留指數(shù)。
保留指數(shù)定性的前提是已經(jīng)有目標(biāo)的保留指數(shù)相關(guān)的報(bào)道,這樣我們才能通過(guò)核對(duì)保留指數(shù)來(lái)定性。
NIST中譜庫(kù)中并不是每個(gè)化合物都有計(jì)算的保留指數(shù)值,但可以通過(guò)AIRI來(lái)預(yù)測(cè)化合物的保留指數(shù)。
正構(gòu)烷烴系列混標(biāo)校正計(jì)算保留指數(shù)
什么是 AIRI?
NIST 使用其廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)測(cè)量保留指數(shù)數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集,通過(guò)化合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)任何化合物的保留指數(shù)。
AIRI 的源代碼和模型由 NIST 發(fā)布。但是,設(shè)置過(guò)程很繁瑣。
Cerno Bioscience 公司正在開(kāi)發(fā)基于網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用程序,通過(guò)化合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)保留指數(shù),讓所有人都能輕松使用 AIRI。
AIRI的參考文獻(xiàn): Predicting Retention Indices and Their Uncertainties Using Artificial Intelligence, Geer, Stein, Mallard, and Slotta,Journal of Chemical Information and Modeling 2024 64 (3),690-696.
方法示例
13.88 分鐘處的未知峰很強(qiáng)且純凈:
盡管如此,但檢索結(jié)果卻很差:
我們可以使用校準(zhǔn)后的GC/MS數(shù)據(jù)確定分子量和分子式:
AIRI預(yù)測(cè)保留指數(shù):
Hybrid Search 混合檢索結(jié)果:
小結(jié):
結(jié)合分子式鑒定、保留指數(shù)和Hybrid Search混合檢索,是一種在單四極桿 GC/MS 上進(jìn)行未知物定性分析的簡(jiǎn)單、快速的方法。
對(duì)于不適合混合檢索的情況:
我們?nèi)匀豢梢允褂帽A糁笖?shù) + 分子式鑒定來(lái)篩選未知化合物潛的潛在候選物。
四極桿GC/MS的分子式鑒定由MassWorks軟件來(lái)完成。
碎片分析也可用于驗(yàn)證鑒定結(jié)果(例如使用 NIST MS Interpreter)。
最終的化合物鑒定還是需要通過(guò)合成化合物來(lái)進(jìn)行確證。
關(guān)于MassWorks 軟件
MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開(kāi)發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們?cè)诘头直媛实乃臉O桿GC/MS、LC/MS直接測(cè)定化合物的精確質(zhì)量,并通過(guò)獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。
關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡(jiǎn)稱(chēng):綠綿科技)以體現(xiàn)客戶(hù)服務(wù)價(jià)值為宗旨,以專(zhuān)業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶(hù)提高分析檢測(cè)的效率和水平。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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