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如何在四極桿GC/MS上創(chuàng)建適用于NIST檢索的精確質(zhì)量譜庫

關(guān)鍵詞:MassWorks 綠綿 質(zhì)譜校準(zhǔn)
時間:2024-04-25 11:35:38

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  MassWorks的質(zhì)譜校準(zhǔn)技術(shù)已經(jīng)被證實能夠?qū)λ臉O桿GC/MS系統(tǒng)中的分子離子或碎片離子實現(xiàn)精確質(zhì)量數(shù)與元素組成測定。這一通常僅在高分辨率質(zhì)譜儀上才具備的能力,現(xiàn)可與NIST譜庫檢索相結(jié)合,以提高化合物鑒定的置信度。

  本文我們將介紹通過MassWorks校準(zhǔn)技術(shù)在低分辨質(zhì)譜上創(chuàng)建“GC/MS精確質(zhì)量譜庫”的新方法。不同于當(dāng)前NIST譜庫僅對分子離子和碎片離子采用整數(shù)質(zhì)量精度的方式,這種新的譜庫方法將擴大對無分子離子的化合物的應(yīng)用范圍,還將通過添加所有碎片離子的精確質(zhì)量,增強對包含分子離子譜圖的譜庫檢索性能,以獲得更加準(zhǔn)確的結(jié)果。

  精確質(zhì)量數(shù)據(jù)采集方法

  圖1顯示了以安捷倫GC/MS為例的數(shù)據(jù)采集的設(shè)置方式,將GC/MS的采集方式選為輪廓(Profile)掃描模式,采樣閾值Threshold設(shè)置為0,然后采集樣品和PFTBA的數(shù)據(jù)。

  在MassWorks軟件中打開PFTBA數(shù)據(jù)用于GC/MS精確質(zhì)量數(shù)校正,然后將其應(yīng)用于樣品譜圖,獲取GC/MS精確質(zhì)量譜圖。

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圖1 安捷倫GC/MS數(shù)據(jù)采集的設(shè)置方式

  創(chuàng)建“GC/MS精確質(zhì)量譜庫”

  創(chuàng)建精確質(zhì)量GC/MS譜庫的包括三個主要步驟:①從MassWorks導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖至NIST MS Search、②對導(dǎo)出的譜圖進(jìn)行編輯,③保存精確質(zhì)量譜圖至譜庫。

  1. 從MassWorks導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖

  從MassWorks向NIST MS Search導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖的操作很簡單。只需在MassWorks的質(zhì)譜譜圖窗口中單擊右鍵,在彈出菜單(見圖2)中選擇“Library Search”,這時將執(zhí)行常規(guī)的NIST譜庫檢索,精確質(zhì)量譜圖將從MassWorks導(dǎo)出至NIST MS Search,如圖3所示,頂部的譜圖是從MassWorks導(dǎo)入的精確質(zhì)量譜圖,下方的譜圖則為NIST庫中原有的整數(shù)質(zhì)量譜圖。在圖3的左下方候選化合物列表窗口中選中正確的化合物,接著繼續(xù)下一步譜圖編輯操作。

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圖2 從MassWorks軟件導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖至NIST MS Search

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圖3 NIST MS search中選中正確的化合物

  2. 編輯“精確質(zhì)量譜圖”

  1) 復(fù)制NIST譜庫目標(biāo)化合物的所有質(zhì)譜圖信息——將圖3右下方“化合物信息”面板中復(fù)制并粘貼至一個txt格式的記事文本中,如圖4所示。

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圖4 粘貼化合物信息至txt文本

  2) 點擊“Librarian”和“Names”標(biāo)簽,打開“Spectrum Information”窗口。選中列表頂部的化合物譜圖,然后點擊“ed”工具欄按鈕(見圖5),使Spectrum Information窗口出現(xiàn)(見圖6)。

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圖5 Librarian界面中選中精確質(zhì)量譜圖

  3)從txt記事本中選擇性地復(fù)制信息并粘貼到“Spectrum Information”窗口,采用以下方式更新各字段內(nèi)容:

 ?、僬迟N化合物的“名稱”。

  ② 粘貼“CAS號”。

 ?、?輸入分子式和分子量。

  ④ 結(jié)構(gòu)式可由化合物的CAS號自動獲取,或者直接粘貼結(jié)構(gòu)圖

 ?、?在“other name”中粘貼化合物的其它名稱。

 ?、拊凇癈omments”中編寫定制消息。

 ?、唿c擊“Replace”(見圖6),更新該化合物譜圖的所有信息。

  經(jīng)過編輯后,精確質(zhì)量譜圖現(xiàn)在擁有包括名稱、分子式、結(jié)構(gòu)等在內(nèi)的完整記錄,并在譜列表窗口頂部以更新后的名稱顯示。

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圖6 為精確質(zhì)量譜圖添加化合物信息

  3. 保存“精確質(zhì)量譜圖”至目標(biāo)譜庫

  在保存精確質(zhì)量譜圖前,需要事先新建一個譜庫,如圖7所示,點擊“Create Library”按鈕,為將要創(chuàng)建的譜庫命名,例如“AM_nist”。

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圖7 新建精確質(zhì)量譜庫

  在圖6中,點擊“Add to library”按鈕,從彈出窗口(見圖8)中選擇已創(chuàng)建的庫,例如“AM_nist”,點擊“OK”完成。

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圖8 選擇譜庫,將精確質(zhì)量譜圖添加至新的譜庫

  成功創(chuàng)建精確質(zhì)量譜庫后,即可在MassWorks中對高質(zhì)量精度的GC/MS譜圖進(jìn)行化合物的精確檢索。在開始檢索之前,需要通過“Library Search Options”將已創(chuàng)建的精確質(zhì)量庫納入搜索范圍。在NIST MS Search的“Option”主菜單項中,選擇“Library Search Options”,點擊“Libraries”標(biāo)簽,選擇“am_nist”,然后點擊“ Add”添加精確質(zhì)量譜庫至檢索目標(biāo)庫(見圖9)。

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圖9 選擇精確質(zhì)量譜庫用于檢索

  精確質(zhì)量譜庫檢索

  執(zhí)行精確質(zhì)量NIST庫檢索的操作與常規(guī)NIST庫檢索相同,如圖2所示,在測試譜圖中啟動NIST檢索,該譜圖的檢索結(jié)果如圖10所示。

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圖10 精確質(zhì)量譜庫檢索結(jié)果

  盡管該化合物在整數(shù)質(zhì)量譜庫和精確質(zhì)量譜庫中均有發(fā)現(xiàn),但使用精確質(zhì)量譜庫時,所有離子的精確質(zhì)量匹配更接近實際測量值,精確質(zhì)量譜庫為檢索提供了更好的質(zhì)量準(zhǔn)確性匹配,因此檢索的匹配度比整數(shù)質(zhì)量譜庫更高,從而提高了鑒定結(jié)果的可靠性。

  基于MassWorks校準(zhǔn)技術(shù)創(chuàng)建的精確質(zhì)量譜庫,可以顯著增強GC/MS系統(tǒng)的鑒定能力,無論是對存在明顯分子離子的化合物,或是對于那些不具備分子離子或存在同分異構(gòu)體混淆情況的化合物。結(jié)合NIST譜庫檢索,這種精確質(zhì)量譜庫方法有助于研究人員準(zhǔn)確、高效地鑒定復(fù)雜樣品中的化合物,無論是在環(huán)境監(jiān)測、風(fēng)味分析、食品安全檢測還是藥物代謝研究等領(lǐng)域,都有廣泛的應(yīng)用潛力。

  關(guān)于MassWorks 軟件

  MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS、LC/MS直接測定化合物的精確質(zhì)量,并通過獨有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。

  關(guān)于綠綿科技

  綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國區(qū)的總代理商,負(fù)責(zé)Cerno公司旗下的MassWorks、GC/ID 等產(chǎn)品市場推廣、銷售、售前/售后技術(shù)支持、應(yīng)用支持。

  若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應(yīng)用,歡迎致電綠綿科技!

關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實驗室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實驗數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測的效率和水平。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8 E-mail:[email protected]。